如今國家政策扶持，醫藥電商可以說是在眾多看好的前景中緩慢前進，而很多人也曾預言醫藥電商會像打車軟件一樣，必須經歷前期的低谷才會走出自己的路。很多醫藥企業為初初進電子商務，一半選擇進駐平臺開設網上藥店，而現在掌握主要流量入口的第三方網上商城卻沖擊著價格，標準的商品注定要在價格上爭上高低，這讓醫藥電商很是受傷，紛紛明白自己做品牌才是出路。
東森醫藥也提出一些建設性意見：互聯網上還有很多渠道，除了天貓旗艦店，醫藥電商應該去別的渠道試試，比如唯品會、聚美，不要在一棵樹上吊死。最終，渠道商只能在淘寶、唯品會、當當這種平臺上賣尾貨，核心商品都歸品牌商的官方旗艦店。
如果醫療器械、計生用品、隱形眼鏡未來都變成品牌商的天下，難道醫藥電商只能賣那些占比只有可憐的20%的OTC產品么？
不少企業提出了自有品牌戰略，比如華佗大藥房、健一網、德生堂很早就在運作，但零售商自有品牌的存在意義在于奉獻利潤，難以撐起銷售。
七樂康雖然以運營能力見長，但至今未曾涉足自有品牌，七樂康網上藥店COO賴裕銳的理由是：“我們沒有精力和能力做好，而且我們一旦有了自有品牌，品牌商便不會跟我們玩了，因為類目里你都有親兒子了！作為渠道商，我要服務整體，進來的客戶有不同的需求，我就滿足它，店鋪的整體服務滿足率高是目的。”
可得網CEO馬力對賴裕銳的觀點表示贊同，和工業企業相比，零售電商更應發揮整合價值：零售商的產品更豐富，用戶的可挖掘價值更大，跨品類的整套式營銷方案更豐富。
一直以來，專業價值被藥店所忽略，品牌直銷可能倒逼醫藥電商重視專業服務。“在互聯網上，作為純粹的賣家毫無價值。買蘋果手機，哪里便宜去哪買，因為消費者對品牌忠誠，對于具體渠道品牌卻無認知度和忠誠度。作為一個醫藥電商賣家，意義在哪里？一定要做藥學服務，只有這個事是不能被取代的。”
健一網總經理何濤或許是最早預料到天貓醫藥館品牌直銷趨勢的人：“我在2013年的時候就拒絕回答天貓和官網如何抉擇的問題，那時候我們開始悄悄轉型，那種流量完全依靠別人、靠標準品競價引流的模式沒有未來。”
作為專業提供電子商務解決方案的樂商軟件預測，醫療器械、隱形眼鏡、計生用品作為醫藥館的三大流量品類，將會被品牌商主導，而且品牌商的官方旗艦店搜索權重比普通商家高，醫藥電商這種渠道商毫無競爭優勢。不超過兩年，大部分商家會被廢掉。
2012年的時候，健一網天貓旗艦店將近40%的銷售是隱形眼鏡，現在有一半是藥品。同時，健一網還在醫藥館里做減法，減少對計生用品的投入，放棄隱形眼鏡品類。“有些同行還在投錢給醫藥館，欲爭高下，做做聚劃算還得廠家說了算，自己不能主導只能打醬油的事情不要干，我寧愿做短期損失。”
互聯網的主流用戶集中在35歲以下，而藥品的主流消費者均在45歲以上，這意味著純網絡的醫藥電商短期之內難有大的發展，只能成為藥品零售業的補充業態。
“醫藥電商的官網純粹走互聯網市場及渠道投放的套路，一年做2個億就到頭了；在天貓醫藥館里開個旗艦店，一年三四個億再往上漲也很難了。”“醫藥電商必須解決流量、處方、患者三大關鍵問題，所以醫藥電商要做的是患者的健康管理，只有這樣才有前景。”
在越來越多醫藥企業加入到電子商務的這塊領域中來，在不久的日子里競爭勢必會越來越激烈。而醫藥企業作為剛進軍電商的企業，想靠打價格戰來贏取市場是不長遠的，未來醫藥電商必定以服務制勝。